在LSF中，可以通过将作业拆分为多个子任务来实现并行计算。这种方法可以加速作业的运行，并最大程度地利用集群中的计算资源。
以下是在LSF中提交作业分多个子任务的一般步骤：
1. 编写作业脚本：编写一个能够将作业分成多个子任务的脚本。例如，您可以使用Bash for循环来迭代作业的不同部分，并将每个部分作为一个独立的子任务提交给LSF。 例如，以下是一个示例Bash脚本，用于将作业分成4个子任务： #!/bin/bash # Define the number of subtasks num_subtasks=4 # Iterate through the subtasks for ((i=1; i<=num_subtasks; i++)) do # Submit the subtask to LSF bsub -J my_job_$i -o my_job_$i.out -e my_job_$i.err my_job_subtask.sh $i done “` 在这个例子中，脚本将作业分成4个子任务，每个子任务都使用`bsub`命令提交到LSF中。每个子任务都使用不同的Job名称（例如“my_job_1”、“my_job_2”等），并将输出和错误日志文件分别写入不同的文件中。
2. 编写子任务脚本：编写一个脚本，用于执行每个子任务的实际计算。这个脚本应该可以接受命令行参数，并使用这些参数来指定该子任务的不同部分。 例如，以下是一个示例Bash脚本，用于执行作业的一个子任务： #!/bin/bash # Get the subtask ID from the command line arguments subtask_id=$1 # Execute the subtask calculation ./my_job_calculation –subtask $subtask_id “` 在这个例子中，脚本使用命令行参数 `$1` 获取子任务的ID，然后调用实际的计算命令来执行该子任务的计算。
3. 提交作业：使用bsub命令提交主作业脚本。例如： bsub -J my_job -o my_job.out -e my_job.err my_job.sh 这将将主作业脚本“my_job.sh”提交到LSF中。LSF将在后台运行该脚本，并将作业拆分为多个子任务，每个子任务都使用单独的Job名称和输出/错误日志文件。 您可以使用`bjobs`命令查看作业的状态和进度，以及每个子任务的状态和进度。
在LSF中提交作业分多个子任务可以提高作业的运行效率，但也需要考虑到作业拆分和并行计算带来的额外复杂性。如果您不熟悉并行计算技术，建议先学习相关的基础知识，以便更好地设计和管理并行作业。
bsub -J job_name 和 bsub -J “job_name[index_list]%job_slot_limit” 是 bsub 命令的选项，用于指定作业（job）的名称。具体含义如下：
• bsub -J job_name ：将作业的名称设置为 job_name。
• bsub -J “job_name[index_list]%job_slot_limit” ：将作业的名称设置为 job_name，并指定作业数组的索引范围为 index_list，以及每个作业数组元素可使用的最大计算资源数为 job_slot_limit。
其中，作业数组是一组具有相同作业名称的作业的集合。在作业数组中，每个作业都有一个唯一的整数索引，可以使用这个索引来标识作业。作业数组可以方便地管理一组类似的作业，例如同种任务的多个实例。
例如，bsub -J “myjob[1-4]%2” 将创建一个名为 myjob 的作业数组，包含4个作业元素，索引分别为 1、2、3、4。每个作业元素可以使用最多2个计算资源。这意味着，每个作业元素只能在最多2个计算节点上运行。如果有多个计算节点可用，这个作业数组的作业元素将按照可用资源的数量进行分配和调度。
测试： 我提交一个名为myjob的job分1-10个数组索引到long_q这个队列 ，同时可以并行3个计算资源，等3个任务跑完会继续跑下面的任务；
提交命令
运行过程
运行结果
